Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfn4Q9D6I3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn4Q9D6I3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms