Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cmtm5Q9D6G9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms