Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc81Q9D5W4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc81Q9D5W4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms