Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Speer4f1Q9D5Q6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Speer4f1Q9D5Q6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms