Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc130Q9D516 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc130Q9D516 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms