Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox2aQ9D4Y3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms