Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sgms2Q9D4B1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sgms2Q9D4B1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms