Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
4933428G20RikQ9D3X4 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
4933428G20RikQ9D3X4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms