Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rsph14Q9D3W1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rsph14Q9D3W1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms