Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3R3

Cep72, Centrosomal protein of 72 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep72Q9D3R3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cep72Q9D3R3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cep72Q9D3R3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms