Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
5430402E10RikQ9D3N5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms