Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim42Q9D2H5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim42Q9D2H5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms