Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snapc3Q9D2C9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Snapc3Q9D2C9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Snapc3Q9D2C9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Snapc3Q9D2C9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Snapc3Q9D2C9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Snapc3Q9D2C9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snapc3Q9D2C9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms