Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trappc6bQ9D289 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trappc6bQ9D289 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms