Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl28Q9D1B9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms