Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Lsm12Q9D0R8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lsm12Q9D0R8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms