Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gtf2e1Q9D0D5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms