Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Nde1Q9CZA6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Nde1Q9CZA6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms