Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm6Q9CZ69 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm6Q9CZ69 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms