Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prelid3bQ9CYY7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prelid3bQ9CYY7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms