Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYQ5

Hcfc1r1, Host cell factor C1 regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hcfc1r1Q9CYQ5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms