Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ube2fQ9CY34 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms