Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q9CXL3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Q9CXL3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms