Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX80

Cygb, Cytoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CygbQ9CX80 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CygbQ9CX80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CygbQ9CX80 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms