Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Utp23Q9CX11 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Utp23Q9CX11 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms