Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ndufaf1Q9CWX2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms