Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cxxc1Q9CWW7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cxxc1Q9CWW7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms