Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prkrip1Q9CWV6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prkrip1Q9CWV6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms