Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn3Q9CVD2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn3Q9CVD2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms