Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MINDY3Q9CV28 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MINDY3Q9CV28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms