Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
4930524J08RikQ9CUJ5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
4930524J08RikQ9CUJ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms