Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nrxn1Q9CS84 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nrxn1Q9CS84 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nrxn1Q9CS84 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms