Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
4933400A11RikQ9CR52 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms