Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ska2Q9CR46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ska2Q9CR46 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms