Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc43Q9CR29 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccdc43Q9CR29 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms