Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rer1Q9CQU3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rer1Q9CQU3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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