Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PompQ9CQT5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PompQ9CQT5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms