Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PsenenQ9CQR7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PsenenQ9CQR7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms