Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl35Q9CQL6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.2 ms