Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RTRAFQ9CQE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RTRAFQ9CQE8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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