Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CQ90 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Q9CQ90 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms