Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atg3Q9CPX6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atg3Q9CPX6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms