Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT5

Nop16, Nucleolar protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop16Q9CPT5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nop16Q9CPT5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms