Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Bcl11bQ99PV8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcl11bQ99PV8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms