Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Scd3Q99PL7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Scd3Q99PL7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms