Protein–RNA interactions for Protein: Q99P81

Abcg3, ATP-binding cassette sub-family G member 3, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg3Q99P81 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Abcg3Q99P81 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Abcg3Q99P81 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms