Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b1Q99NB9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b1Q99NB9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms