Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gdpd3Q99LY2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gdpd3Q99LY2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms