Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp16Q99LG0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp16Q99LG0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Usp16Q99LG0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms