Protein–RNA interactions for Protein: Q99KV1

Dnajb11, DnaJ homolog subfamily B member 11, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb11Q99KV1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Dnajb11Q99KV1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Dnajb11Q99KV1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms